(一)規劃組織：完成中心組織規劃及籌設中心固定辦公室。

  (二)建置組織：中心之組織運作以團隊協調合作為主，設中心主任及執行秘書，負責整合校內倫理教學資源、協調專業倫理課程之開課、專案計畫、工作坊、經費、研討會、諮詢服務等業務之規劃及推動；另支援人力若干人，襄助主任及執行秘書執行業務及協調相關行政事宜。中心主任由學術副校長兼任，執行秘書由由校長就專任教授或副教授中聘兼之。

  (三)組織分工與人力配置：中心內設置一般倫理組、專業倫理組、教育推廣組等三組，各組設組長一人，負責各組任務之推廣。各組負責業務如下：

    1.一般倫理組—組長由一般倫理教師推選出，負責針對各種應用倫理學議題與專業倫理課程教師建立科際整合的研究團隊；協助及支援專業倫理教學工作；爭取環保署環境教育機構認證之規劃。

    2.專業倫理組—組長由專業倫理課程教師推選出，負責成立「專業倫理課程委員會」，推動專業倫理課程開課，協助教師教學，舉辦教師教學研習或工作坊。

    3.教育推廣組—組長由專業倫理課程教師推選出，負責中心網頁建置、成果推廣、產業界諮詢服務以及產學合作計畫之推動，接受委辦南區環境教育人員講習課程之規劃及活動。

  (四)成立「專業倫理課程委員會」。

  (五)強化本校及南區科大的應用倫理課程，提升課程品質。

  (六)設置研究中心網頁，蒐集國內、外資料，建立一般及專業倫理網路資料庫。

  (七)蒐集國內、外現有之一般與專業倫理學著作、影音資料，建立一般及專業倫理圖書資料庫。

  (八)配合本校教學發展中心、科技與社會學門[STS]計畫辦公室及通識教育中心，舉辦專業倫理教師工作坊及一般倫理講座。

  (九)支援各學院及南區個學校專業倫理課程的授課及協調。

  (十)編製應用倫理素養量表、應用倫理素養觀察評量表，以檢測推動應用倫理素養的績效。

  (十一)每二年舉辦一次「應用倫理學」學術或專業倫理教材教法研討會，並將論文上傳於中心網頁。

  (十二)開發專業倫理及一般倫理教材，並與書商簽訂產學合作予以出版。

  (十三)組成一般與專業倫理學術研究社群，爭取國科會、教育部、地方政府和企業或民間文化團體之相關專案研究計畫。

  (十四)爭取環保署環境教育機構認證，接受委辦南區環境教育人員講習課程。